法医学专业为国家级特色专业，具有法医学硕士学位授予权。学生主要学习基础医学、临床医学、法学及法医学的基本理论及基本知识，受到医学及法医学的基本技能训练，具有法医学检案鉴定的基本能力。皖南医学院设有一级学科硕士点3个、二级学科硕士点31个、专业硕士学位点1个。有省级重点学科2个、省临床医学重点学科1个、省重点发展学科3个、省特色专科6个。
医药高等数学、医学物理学、医学统计学、基础化学、有机化学、医学生物学、卫生法学、解剖学、组织学与胚胎学、医学微生物学、医学细胞生物学、医学遗传学、生物化学与分子生物学、生理学、病理学、病理生理学、医学免疫学、药理学、神经科学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、眼科学、诊断学、医学影像学等。
体检标准：按《普通高等学校招生体检工作指导意见》及有关规定执行。新生入校后需进行体格检查，体检结果异常者按我校有关规定执行。鉴于法医学专业学生就业需要，除满足上述体检标准外，还需符合《公安机关人民警察录用办法》的具体要求，男性身高不低于68米，女性身高不低于58米，左右眼单眼裸视力应在9(0.8)以上，无色盲、色弱，年龄不超过20周岁(1993年7月后出生)。
法医学专业培养掌握基础医学、临床医学、法学以及法医学的基本理论、基本知识;掌握法医学的基本技术和案例分析的思维方法;具备医学的基本理论知识和系统的法医学理论知识及基本技能，能在公安、政法机关、司法鉴定机构和保险公司从事法医学检案鉴定工作的高级科学技术人才。
就业方向法医学专业可在全国各级公安部门、检察院、司法机关、鉴定机构、医院、高等院校及保险公司等从事法医学鉴定、医疗服务、法医学及医学科研、教学、保险服务等工作。伴随着国家法制化建设进程的推进和对司法鉴定技术工作的日益重视，未来数年全国范围内对法医学专业毕业生需求量旺盛。平均就业率达97%以上，就业单位为全国各地(市)的公安、检察机关以及司法鉴定机构等部门。
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