吉首大学医学院拥有临床医学一级学科专业硕士学位授权点、两个生物学二级学科硕士学位授权点。开设有临床医学、护理学、针灸推拿学、医学影像技术和医学检验技术等五个全日制本科专业，护理学和针灸推拿学两个全日制专科专业;其中，针灸推拿学专业具有留学生招生权。医学院面向全国15个省(市)招生，在校生数达2700余人。
医学院拥有“卓越医生教育培养计划试点高校”等三个国家级教学平台，建有基础医学实验室、临床技能实践教学中心和医学虚拟仿真实验教学中心(省级示范中心);拥有校级医学研究中心科研平台和慢性病的转化医学研究创新团队。实验室总面积近8000平方米，拥有教学仪器设备1400万元。现有附属医院4所、教学医院4所、实习医院20所、社区医疗服务中心教学点3家，可为医学生的理论教学和实践教学提供有力保障。
临床医学专业：吉首大学医学院于2000年9月8日由1958年创办的湖南省湘西土家族苗族自治州吉首卫生学校与1978建立的吉首大学医疗系合并组建成立。自医学院成立以来，在吉首大学党委行政的正确领导下，办学条件、办学层次和办学实力得到了不断改善和提高，教学与科研水平获得了前所未有的提升。临床医学专业学生主要学习医学方面的基础理论和基本知识，人类疾病的诊断、治疗、预防方面的基本训练.具有对人类疾病的病因、发病机制做出分类鉴别的能力。
临床医学专业培养目标：临床医学专业旨在培养具有良好思想道德与职业素质，掌握基础医学、临床医学的基础知识、基本理论和基本技能，具备较强的临床实践能力、一定的医学人文知识和终身学习能力，能在基层医疗卫生单位从事临床医疗和预防保健等工作的高级应用型医学专门人才。
吉首大学医学院专业简介及专业培养目标针灸推拿学专业：医学院近年来承担国家自科基金课题15项，国家社科基金课题4项，省部级课题100余项，地市级课题120余项;获省级科技、教学成果奖5项，地市级成果奖10项;获国家专利6项，出版教材及专著24部，发表论文900余篇，其中被SCI、CSCD 收录120余篇。针灸和推拿属养生治病之道。针、灸有别，针法指在体表的腧穴上进行针刺、叩击、放血等操作，灸则指用艾绒做成艾柱、艾条或艾绒装入温灸器中，点燃后熏灼皮肤的一定穴位，进行温热刺激。
针灸推拿学专业培养目标：针灸推拿学专业旨在培养德、智、体全面发展，具有扎实的中医基本理论与基本知识，掌握针灸和推拿技能，擅长小儿推拿，熟悉中医骨伤诊疗技术，具备一定的现代医学知识及技能、中医传承能力和中医临床思维能力，能在各级医疗卫生机构从事针灸推拿、中医骨伤、康复与保健等工作的高级应用型医学专门人才。
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