哈尔滨医科大学开设临床医学、医学检验等专业，学校有国家级实验教学示范中心4个，国家级虚拟仿真实验教学中心1个。主编教育部、卫健委“十二五”规划教材63部。获批教育部卓越医生教育培养计划改革试点项目3项。获国家视频公开课程4门、国家资源共享课程12门、国家精品在线开放课程1门。共获国家级教学成果奖16项，省级教学成果奖139项。“十二五”以来，立项教育科研课题689项，发表教育教学论文827篇，其中SCI收录5篇。
哈尔滨医科大学“十二五”以来，学校获得各类科研项目8528项，主持国家重点基础研究发展计划（“973”计划）1项、国家高技术发展计划（“863”计划）1项、国家科技重大专项1项、国家重点研发计划专项2项，国家自然科学基金1228项。获各种奖励876项，其中，国家科学技术进步奖二等奖1项、高等学校科学研究优秀成果奖（科学研究）一等奖5项、中华医学科技奖一等奖2项。获国家自然科学基金委员会创新研究群体项目1项、教育部科技创新团队2个。发表科学研究论文19805篇，其中SCI收录7161篇。编写出版著作628部。拥有有效专利434件，发明专利182件，软件及著作权10件。
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