教育部直属的好处是教育部直属的高校级别要高。而且部分教育部直属高校的校长是副部级。一般的高校校长是副厅级。再者是师资力量，办学能力等实力上的区别。一般情况下，部级单位直属学校实力较强大。
教育部直属高校一般指中华人民共和国教育部直属高等学校。中华人民共和国教育部直属高等学校指由中华人民共和国教育部直属管理的一批高等学校，是中央部门直属高等学校的重要组成部分。中华人民共和国教育部直接管理一批高等院校，目的是在探索改革上先走一步，在提高教学、科研和社会服务等方面发挥示范作用。经过全国高校管理体制的调整，一批实力较强、学科特色鲜明的高校均划归教育部直属管理，建国以来国家历次所确定的全国重点大学多为教育部直属高校。
教育部直属高校名单省区学校名称所在地北京 北京大学 北京市
中国人民大学
清华大学
北京交通大学
北京科技大学
北京邮电大学
北京化工大学
中国农业大学
北京林业大学
北京中医药大学
北京师范大学
北京外国语大学
北京语言大学
对外经济贸易大学
中央美术学院
中央音乐学院
中央财经大学
中国政法大学
中国传媒大学
华北电力大学
国际关系学院
中央戏剧学院
中国地质大学（北京）
中国矿业大学（北京）
中国石油大学（北京）
天津 南开大学 天津市
天津大学
辽宁 东北大学 沈阳市
大连理工大学 大连市
吉林 吉林大学 长春市
东北师范大学
黑龙江 东北林业大学 哈尔滨市
上海 复旦大学 上海市
同济大学
上海交通大学
华东理工大学
东华大学
华东师范大学
上海外国语大学
上海财经大学
江苏 南京大学 南京市
东南大学
南京农业大学
河海大学
中国药科大学
中国矿业大学 徐州市
江南大学 无锡市
浙江 浙江大学 杭州市
安徽 合肥工业大学 合肥市
福建 厦门大学 厦门市
山东 山东大学 济南市
中国海洋大学 青岛市
中国石油大学（华东）
湖北 武汉大学 武汉市
中南财经政法大学
华中科技大学
武汉理工大学
中国地质大学（武汉）
华中农业大学
华中师范大学
湖南 中南大学 长沙市
湖南大学
广东 中山大学 广州市
华南理工大学
重庆 重庆大学 重庆市
西南大学
四川 四川大学 成都市
电子科技大学
西南交通大学
西南财经大学
陕西 西安交通大学 西安市
西北农林科技大学
西安电子科技大学
陕西师范大学
长安大学
甘肃 兰州大学 兰州市
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