新疆医科大学厚博学院于2003年5月6日在乌鲁木齐获准成立，2004年2月5日由国家教育部教发函〔2004〕13号文件确认，是由新疆医科大学举办的、充分依托大学优质教育资源和办学优势建设发展的独立学院。2012年12月6日，克拉玛依市委市政府与新疆医科大学共同签订了合作建设新疆医科大学厚博学院协议书。2015年9月新校区落成，学院正式搬迁至克拉玛依市。克拉玛依校区位于克拉玛依市城南新区，规划总面积1500余亩，总建筑面积24万平方米。校园由美国NBBJ公司规划设计，学院建设完成后，硬件条件、基础设施将达到国内一流水平。此外，学院的临床教学和实习基地依托新疆医科大学的母体优势，基本可以满足实践教学和临床实习需求。
校园环境优美，推窗见绿，出门见景，四季见花，学校配套设施设备完善，4G网络覆盖全校。拥有先进的网络计算机室、电子阅览室、多功能电教室、多媒体双控系统等。教学实训中心功能齐全，设施先进，专业特色鲜明。学校建有标准的塑胶田径运动场、篮球场、足球场、羽毛球场、形体室等。教室均配备多媒体教学设备、冷暖空调、手机充电插座等；学校学生宿舍全部为单元式学生公寓，寝室一般为六人间或四人间或八人间，寝室内配备空调、书桌、衣柜、网络端口以及独立的卫生间和淋浴设施。学生寝室实行24小时专人管理，学生食堂宽敞明亮，可同时容纳2000人用餐，餐厅提供20多种菜品供学生自主选择。
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